L’ingénieur travaillera au sein de l’équipe NeuroPsychologie Interventionnelle (NPI), unité de recherche mixte (INSERM, UPEC, ENS), dirigée par le Prof. Anne-Catherine Bachoud-Lévi, présente sur deux sites :
- l’Institut Mondor de Recherche Biomédicale (UPEC, Créteil)
- l’Institut d’Études de la Cognition (IEC) (École Normale Supérieure, Paris).
L’équipe du Pr. Bachoud-Lévi est reconnue internationalement pour sa recherche sur les biothérapies des maladies neurodégénératives, telles que les greffes neuronales (maladie de Huntington) et la thérapie génique (maladies de Parkinson et d' Huntington). L’originalité de l’équipe repose sur la conjonction d’une activité de recherche clinique sur les nouvelles thérapies et de recherche fondamentale en cognition.
Les programmes de recherche translationnelle du NPI sont assurés grâce à l’intégration forte de l'équipe au sein du service de neurologie de l'hôpital Henri Mondor (AP-HP, Créteil) qui regroupe le centre de référence national de la maladie de Huntington et un centre expert Parkinson. Le service suit plusieurs centaines de patients par an dans le cadre d’essais cliniques observationnels et thérapeutiques.
L'équipe est également impliquée dans de multiples réseaux nationaux et internationaux tels que l'infrastructure nationale de recherche translationnelle NeurATRIS, l'infrastructure nationale de recherche clinique F-CRIN ou le réseau européen de référence pour les maladies neurologiques rares.
Les activités de recherche et d'innovation sont facilitées par une équipe expérimentée composée de responsables scientifiques et cliniques, de statisticiens, de gestionnaires de données, de neuropsychologues et d'orthophonistes. L'équipe bénéficie également du soutien de l'Unité de recherche clinique (statistiques et questions réglementaires) et du Centre d'investigation clinique de l'hôpital Henri Mondor.
Missions :
L’ingénieur, sous la supervision du chef de projets scientifiques du NPI, :
- sera chargé de la gestion des bases de données du laboratoire qui devront être construites à partir d’extraction de bases de données de l’AP-HP, de sorties de tests informatisés, de données d’imagerie et de données de voix. L’ingénieur sera responsable du maintien et de la mise en place de procédures opérationnelles normalisées permettant de construire des tables de données vérifiées pour les analyses statistiques. Ces procédures lui serviront à fournir les tables aux chercheurs et statisticiens en fonction des besoins des projets.
- sera en charge de la mise en place et du maintien des environnements du laboratoire sur les serveurs Unix de l’UPEC dédiés au stockage des données, à leur prétraitement et aux analyses statistiques. L’ingénieur travaillera en collaboration avec les informaticiens de l’IMRB et de l’ENS. Il assistera les membres du laboratoire pour l’utilisation de logiciels de prétraitement de données (e.g. logiciel de gestion de campagnes d’annotations d’enregistrements de voix, https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02496041v1). Il assistera les statisticiens et chercheurs du laboratoire pour la configuration des environnements nécessaires aux analyses statistiques (installation de packages R, python…).
- participera au développement par le laboratoire de tâches cognitives informatisées, destinées au suivi de patients atteints de déficits neurologiques. L’ingénieur sera responsable de la mise en place et de la réalisation des tests de validation de logiciels (Android, iOS, Java FX…) fournis par les prestataires et collaborateurs du laboratoire. L’ingénieur pourra être amené à réaliser des mises à jour des logiciels.
- sera en charge de l’environnement IT nécessaire à la conduite d’études cliniques menées par la laboratoire : installation, configuration et maintenance des outils technologiques (tablettes, logiciels, serveurs gérés par l’UPEC…)
- participera à la rédaction de cahiers des charges pour le développement des nouveaux outils technologiques du laboratoire (e.g. développement d’une plateforme permettant le suivi à distance de patients). L’ingénieur pourra également participer au suivi du développement de ces outils.
Compétences requises :
- Bonne maîtrise de langages informatiques (ex. Python, R, java) ;
- Maîtrise des outils de gestion de bases de données (ex langage de requête SQL et base de données MySQL, Postgresql) ;
- Bonne maîtrise de l’anglais ;
- Une connaissance des statistiques de base serait apprécié ;
- Des connaissances en java pour Android et du système d’exploitation Unix sont un plus ;
- Bonne capacité de travail en équipe.
Diplôme requis : Bac + 5.
Expérience professionnelle souhaitée : Au moins 2 années d’expérience professionnelle.
Contrat : 1 an renouvelable, salaire en fonction de l’expérience.
Personne à contacter : rmassart.npi@gmail.com